Fue constituido por canarios en la región de Barlovento, en la provincia de Caracas, allí fundaran una villa de treinta haciendas cacaoteras donde predomina la pequeña propiedad. Sin embargo, por varias razones históricas su población llegó a ser fundamentalmente de origen africana. Fundado por Juan Francisco de León, Panaquire aparece ligado a la historia de la independencia de Venezuela. Al contrario de otros pueblos en la misma zona y época, fue fundado en la ribera sur del río Tuy. Esto podría estar relacionado con las actividades de contrabando de cacao que se realizaron desde la misma, y que llevaron al conflicto con la Real Compañía Guipuzcoana en 1748 y 1750. La ribera sur era inaccesible por tierra, dando tiempo a los habitantes del pueblo a reaccionar frente a la llegada de funcionarios del estado.